Возникновение токсикологической (ранее — судебной) химии как науки было обусловлено потребностями судебно-медицинской токсикологии. Этому предшествовал длительный период проведения отдельных судебно-медицинских экспретиз и химических исследований. Затем появилась и начала совершенствоваться судебно-химическая экспертиза, в которой были заинтересованы прежде всего судебно-медицинские эксперты.
История возникновения медицинской службы в России связана с Аптекарским приказом, упоминание о котором приходится на 1554 год. Достаточно долго Аптекарский приказ ведал всем врачебным и аптекарским делом в России. В нем рассматривались и судебные дела, “касающиеся врачей и аптекарей”. С ним связано возникновение медицинской, а вместе с нею химической и фармакогностической экспертиз для различных государственных целей. Поводами для производства экспертиз первоначально являлись: определение телесных повреждений; установление причин смерти, в частности смерти от отравления; определение психического состояния людей; определение пригодности к несению военной службы; установление незаконного врачевания или наличия врачебных ошибок и некоторые другие.
Длительное время экспертные исследования не были регламентированы законом и проводились от случая к случаю.